Noteiktos gadījumos ir nepieciešams mainīt shapefile projekciju. To var efektīvi izdarīt QGIS, pārsaglabājot shapefile ar vēlamajiem projekcijas iestatījumiem. Process ietver virkni soļu, sākot ar shapefile atvēršanu QGIS. Kad fails ir ielādēts, lietotājam jāsāk eksporta process, kura laikā ir būtiski iestatīt pareizo projekciju.
Veicot šos soļus, shapefile projekciju var mainīt, lai tā atbilstu konkrētajām projekta vai analīzes prasībām.